Автор работает во многих жанрах, но больше всего известен остросюжетными романами, где происходят таинственные события и невероятные приключения. «Пугало» – мистический триллер о детстве, «Солнечный принц» – страшная сказка о засекреченном военном объекте, «Амфора» – история отношений человека и древнего божества.
Серия детективов «Друг мой сыщик» – 12 книг, которые можно читать в любой последовательности, поскольку в каждой рассказана отдельная история. Действие происходит в Ялте. Старые друзья, журналист и следователь, сталкиваются с загадочными убийствами, которые кажутся проявлением потусторонних сил.
В жанре юмора и сатиры – книги рассказов из цикла «Автостопом по восьмидесятым», где описаны веселые и опасные приключения двух друзей, вечных студентов, которые бесконечно путешествуют по СССР всеми возможными и невозможными способами.
В разделе «Современная проза» – романы «Когда приходит Андж», «Человек-тело», книги «Ave Media» и «Собиратель грёз» – опыты постмодернизма, метатекста, эротики, а также уникального жанра, открытого самим автором, который современная критика называет «авемедией».
Первые произведения Сергея Саканского (рассказы с легким диссидентским уклоном) публиковались в семидесятых, когда ему было 20 лет. Последние годы он является постоянным автором журнала «Искатель» (детективные и фантастические произведения). Художественная проза выходит в журналах и альманахах, а также отдельными книгами, переводится на иностранные языки. Книги писателя дважды выдвигались на премию «Национальный бестселлер».