«Жизнь в режиме отладки 2» автора Гизум Герко продолжает историю Алексея Стаханова, который работает в закрытом государственном научно-исследовательском институте, занимающемся изучением явлений на грани современных научных знаний. Главный герой теперь является полноценным сотрудником института и имеет доступ к секретным материалам и проектам, которые связаны с аномальными полями и неизвестными феноменами.
Сюжет начинается с того, что Алексей получает повышение и расширенный доступ к архиву «Наследие-1». Вместо привычных документов он обнаруживает необычную информационную структуру, не похожую на стандартные интерфейсы. В рабочей обстановке он сталкивается с критикой своих предположений от профессора Зайцева, который считает, что Алексей неправильно трактует результаты экспериментов и слишком увлекается идеями о сознании аномальных полей. В ответ на это вмешивается коллега Алиса, которая подтверждает, что наблюдаемые эффекты не вписываются в известные научные модели.
Дальнейшее развитие связано с изучением аномального поля, которое проявляет признаки целенаправленного воздействия и способно взаимодействовать не только с неорганическими объектами, но и с живыми организмами. Алексей участвует в подготовке и запуске сложного информационного пакета для связи с этим феноменом, который в лабораторных условиях проявляет признаки разума и информационной активности. В ходе обсуждений и экспериментов выясняется, что феномен способен выводить на свет кристаллов математические последовательности и даже подключаться к компьютерным сетям, что вызывает серьезные вопросы у ученых.
Главным конфликтом становится противостояние скептицизма и научного долга. Профессор Кацнельбоген, руководитель отдела, сначала сомневается в идее влияния разумного поля на биологию, но под давлением фактов соглашается выделить специалиста, который будет работать со специальной группой для изучения феномена. Алексей и его коллеги проводят анализ и настраивают оборудование для приема слабых сигналов, пытаясь понять природу и потенциал этого «информационного разума».
В процессе работы герой сталкивается с необходимостью принимать решения, связанные с сотрудничеством между разными отделами института, преодолением внутреннего скептицизма и взаимодействием с аномальными явлениями, которые выходят за рамки традиционной науки. Алексей принимает участие в установлении контакта с этим феноменом, что открывает новые возможности и одновременно создает серьезные вызовы для института и исследовательской группы.
В итоге сюжет концентрируется на вопросах, связанных с пониманием и контролем необычных научных проявлений, которые влекут за собой пересмотр привычных научных подходов. Главной темой остается выбор между традиционным скептицизмом и необходимостью идти навстречу неизвестному, что требует от главного героя и его команды готовности к новым открытиям и ответственности за последствия этих исследований.