Профессор русской истории в московской духовной академии и в московском университете (в последнем — с 1879 г.); в настоящее время состоит председателем Московского общества истории и древностей. Во время существования в Москве высших женских курсов, профессор К. читал на них лекции по русской истории, а после закрытия этих курсов участвовал в организованных московскими профессорами публичных лекциях. Не особенно многочисленные, но богатые содержанием ученые исследования К., из ряда которых особенно выдается его докторская диссертация («Боярская дума»), посвящены по преимуществу разъяснению основных вопросов истории управления и социального строя московского государства XV—XVII вв. Широкий размах исследования, охватывающего наиболее существенные стороны жизни государства и общества в их взаимной связи, редкий дар критического анализа, доходящего иногда до мелочности, но приводящего к богатым результатам, блестящий талант изложения — все эти особенности трудов К., давно признанные специальной критикой, помогли ему обогатить науку русской истории рядом новых и ценных обобщений и выдвинули его самого на одно из первых мест среди ее исследователей.

Помимо научных работ, К. выступал со статьями популярного и публицистического характера, помещая их, главным, образом в «Русской Мысли». Сохраняя и здесь свойственный ему талант изложения, К. отходил в этих статьях все далее и далее от научной почвы, хотя и пытался удержать ее за собой. Отличительной их чертой служит националистический оттенок взглядов автора, стоящий в тесной связи с идеализацией московской старины XVI—XVII вв. и оптимистическим отношением к современной русской действительности.

«Хозяйственная деятельность Соловецкого монастыря в Беломорском крае» (1867)
«Древнерусские жития святых» (1871)
«Псковские споры» (1872)
«Сказание о чудесах Владимирской иконы божьей матери» (1878)
«Боярская Дума древней Руси» (1880—1881)
«Русский рубль XVI—XVIII вв. в его отношении к нынешнему» (1884)
«Происхождение крепостного права в России» (1885)
«Подушная подать и отмена холопства в России» (1886)
«Евгений Онегин и его предки» (1887)
«Состав представительства на земских соборах древней Руси» (1890)
Полный курс Русской истории
Исторические портреты (О Болтине, Карамзине, Соловьеве). — М., 1991.
Исторические портреты. Статьи: «Значение преподобного Сергия для русского народа и государства», «Добрые Люди древней Руси», «Характеристика царя Ивана Грозного», «Царь Алексей Михайлович», «Жизнь Петра Великого до начала Северной войны»

В феврале 1966 года улице Поповка в Пензе, где будущий историк провёл детские и юношеские годы (1851—1861), было присвоено имя Ключевского.
В 1991 году в Пензе, в доме на улице Ключевского, 66, был открыт музей В. О. Ключевского.
В 1991 году была выпущена почтовая марка СССР, посвященная Ключевскому.
C 1994 Президиум Российской академии наук присуждает Премию им. В. О. Ключевского за работы в области отечественной истории.
11 октября 2008 года в Пензе был установлен первый в России памятник В. О. Ключевскому